会員グループごとに一律で割引率を販売できるので、かんたんに設定できます。
【商品管理】→【会員制限設定】で、以下のように設定するだけでOKです。

会員グループは【受注管理】→【会員グループ設定】で作成してください。
この例では「ブロンズ」「シルバー」「ゴールド」「プラチナ」の4グループを作成しています。

未会員をショップにアクセスできないようにしたい場合

ここで、未会員のショップへのアクセスを「アクセス不可」に設定すると、サイトにアクセスした際にはログイン画面のみが表示され、ショップページは表示されません。

会員制限機能を設定する際には、適用の優先順位を覚えておくと便利です。
商品登録画面での会員制限設定 ＞ カテゴリ管理での会員制限設定 ＞ 会員制限設定画面での設定の順で優先されます。

色づけされている会員グループ/カテゴリは、先の設定から変更がありませんので、色がついていない会員グループを含むカテゴリについてのみ、カテゴリでの会員制限設定が必要になります。
商品カテゴリA、商品カテゴリCについて 【商品管理】→【カテゴリ別会員制限設定】で「以下に個別設定する」を選択し、下記のように設定します。

●商品カテゴリAの設定

●商品カテゴリBの設定

●商品カテゴリCの設定

これまでの設定をもとに、たとえば、下記のように販売するとします。

かなり複雑な設定に見えますが、会員制限機能を使っての適用の優先順位を思い出すと難しくありません。
商品登録画面での会員制限設定 ＞ カテゴリ管理での会員制限設定 ＞ 会員制限設定画面での設定の順で優先されます。

そうすると、色づけされている会員グループ/カテゴリは、これまでに設定が完了していますので、色がついていない商品について、商品ごとに、下記のように会員制限設定をします。
各商品登録画面の会員制限設定欄で「以下に個別設定する」を選択し、下記のように設定します。

（※1）一部商品のみを表示して販売はしない

カテゴリを非表示にしている場合でも、そのカテゴリに表示設定されている商品が含まれる場合、ログイン後にそのカテゴリが表示されます。
表示する商品に下記のように設定してください。

【商品の表示】: 表示　【商品価格の表示】: 売価を表示しない(販売不可)

（※2）一部商品は表示しない

表示しない商品に下記のように設定してください。

【商品の表示】: 非表示

（※3）一部商品のみ通常販売価格で販売

通常販売価格で販売する商品に下記のように設定してください。

【商品の表示】: 表示　【商品価格の表示】: 売価で販売する

（※4）商品により異なる割引率で販売

商品ごとに下記のように割引率を設定してください。

【商品の表示】: 表示　【商品価格の表示】: 売価の**%引で販売する（**%に割引率を入力）

（※5）一部商品のみ10%offで販売する

10%offで販売する商品に下記のように設定してください。

【商品の表示】: 表示　【商品価格の表示】: 売価の10%引で販売する

このように、全体→カテゴリ→商品の順に設定すると、設定しやすくなります。

会員制限設定の設定内容確認について

設定した内容は、【商品管理】→【会員制限設定確認】で確認できます。
「カテゴリを選択」でカテゴリを絞り込むと、個別に設定した商品の確認と、商品ごとの設定の解除ができます。